MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Mesorhizobium loti MAFF303099 chromosome

Total Repeats: 18194

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_002678	GC	3	6	1201008	1201013	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3002	NC_002678	CGGC	2	8	1201015	1201022	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3003	NC_002678	CGGC	2	8	1201025	1201032	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3004	NC_002678	CGAA	2	8	1201034	1201041	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3005	NC_002678	CCGG	2	8	1201127	1201134	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3006	NC_002678	GAAACA	2	12	1201161	1201172	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
3007	NC_002678	CCT	2	6	1201182	1201187	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3008	NC_002678	T	6	6	1203026	1203031	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3009	NC_002678	CAG	2	6	1203980	1203985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3010	NC_002678	CT	3	6	1204966	1204971	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3011	NC_002678	AGT	2	6	1206911	1206916	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3012	NC_002678	CGGAG	2	10	1207023	1207032	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
3013	NC_002678	T	6	6	1210424	1210429	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3014	NC_002678	A	6	6	1212035	1212040	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3015	NC_002678	GTT	2	6	1214438	1214443	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3016	NC_002678	GCC	2	6	1214483	1214488	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3017	NC_002678	CAT	2	6	1214491	1214496	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3018	NC_002678	GTC	2	6	1214523	1214528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3019	NC_002678	TGC	2	6	1217096	1217101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3020	NC_002678	GCA	2	6	1217133	1217138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3021	NC_002678	TCA	2	6	1217150	1217155	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3022	NC_002678	AGC	2	6	1217186	1217191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3023	NC_002678	CCT	2	6	1217202	1217207	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3024	NC_002678	CGA	2	6	1217268	1217273	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3025	NC_002678	CCG	2	6	1217306	1217311	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3026	NC_002678	CTC	2	6	1217664	1217669	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3027	NC_002678	CTG	2	6	1217686	1217691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3028	NC_002678	GCT	2	6	1217713	1217718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3029	NC_002678	GCG	2	6	1217749	1217754	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3030	NC_002678	CGC	2	6	1217757	1217762	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3031	NC_002678	GCG	2	6	1220425	1220430	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3032	NC_002678	CGAT	2	8	1220441	1220448	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3033	NC_002678	AT	3	6	1220447	1220452	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3034	NC_002678	CCG	2	6	1220505	1220510	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3035	NC_002678	GACG	2	8	1220524	1220531	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3036	NC_002678	TG	3	6	1221666	1221671	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3037	NC_002678	ACTC	2	8	1221736	1221743	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3038	NC_002678	CGG	2	6	1221744	1221749	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3039	NC_002678	AG	3	6	1221761	1221766	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3040	NC_002678	CGAT	2	8	1222148	1222155	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3041	NC_002678	GC	3	6	1222166	1222171	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3042	NC_002678	CTC	2	6	1222196	1222201	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3043	NC_002678	CCA	2	6	1222398	1222403	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3044	NC_002678	GAC	2	6	1222416	1222421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3045	NC_002678	CGA	2	6	1222453	1222458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3046	NC_002678	ACC	2	6	1222492	1222497	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3047	NC_002678	GCT	2	6	1222551	1222556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3048	NC_002678	TCCC	2	8	1222647	1222654	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
3049	NC_002678	T	6	6	1222683	1222688	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3050	NC_002678	GCC	2	6	1222723	1222728	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3051	NC_002678	CTT	2	6	1224572	1224577	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3052	NC_002678	GCC	3	9	1224591	1224599	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3053	NC_002678	CAG	2	6	1224649	1224654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3054	NC_002678	TA	3	6	1224739	1224744	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3055	NC_002678	GCC	2	6	1225461	1225466	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3056	NC_002678	TCG	2	6	1225479	1225484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3057	NC_002678	CGACG	2	10	1225501	1225510	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
3058	NC_002678	CGC	2	6	1225530	1225535	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3059	NC_002678	ACC	2	6	1225580	1225585	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3060	NC_002678	CGG	2	6	1228420	1228425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3061	NC_002678	GCA	2	6	1228477	1228482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3062	NC_002678	TTGA	2	8	1234392	1234399	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3063	NC_002678	TCC	2	6	1236058	1236063	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3064	NC_002678	TGG	2	6	1236116	1236121	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3065	NC_002678	CTG	2	6	1236168	1236173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3066	NC_002678	GTG	2	6	1236304	1236309	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3067	NC_002678	CGG	2	6	1236371	1236376	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3068	NC_002678	TCT	2	6	1236393	1236398	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3069	NC_002678	TCG	2	6	1236416	1236421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3070	NC_002678	GA	3	6	1236470	1236475	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3071	NC_002678	GGC	2	6	1236478	1236483	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3072	NC_002678	CATC	2	8	1236516	1236523	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3073	NC_002678	ACG	2	6	1236524	1236529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3074	NC_002678	GAC	2	6	1236568	1236573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3075	NC_002678	GAGC	2	8	1236669	1236676	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3076	NC_002678	CGGC	2	8	1238824	1238831	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3077	NC_002678	GCC	2	6	1238845	1238850	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3078	NC_002678	AGCGG	2	10	1238916	1238925	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
3079	NC_002678	GTT	2	6	1238945	1238950	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3080	NC_002678	ACGG	2	8	1238953	1238960	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3081	NC_002678	CTGC	2	8	1239773	1239780	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3082	NC_002678	TGA	2	6	1241556	1241561	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3083	NC_002678	CTC	2	6	1241600	1241605	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3084	NC_002678	CAT	2	6	1241702	1241707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3085	NC_002678	CCGG	2	8	1241772	1241779	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3086	NC_002678	GC	3	6	1242471	1242476	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3087	NC_002678	ACG	2	6	1245918	1245923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3088	NC_002678	GCGA	2	8	1245933	1245940	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3089	NC_002678	CG	3	6	1246237	1246242	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3090	NC_002678	G	6	6	1246305	1246310	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3091	NC_002678	CGA	2	6	1246346	1246351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3092	NC_002678	CG	4	8	1246388	1246395	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3093	NC_002678	AGC	2	6	1248866	1248871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3094	NC_002678	CGG	2	6	1250778	1250783	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3095	NC_002678	GCCG	2	8	1250788	1250795	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3096	NC_002678	CGGC	2	8	1250805	1250812	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3097	NC_002678	TCC	2	6	1251840	1251845	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3098	NC_002678	CTC	2	6	1251906	1251911	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3099	NC_002678	TC	3	6	1251923	1251928	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3100	NC_002678	CTC	2	6	1253885	1253890	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3101	NC_002678	AC	3	6	1253967	1253972	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3102	NC_002678	GGC	2	6	1254031	1254036	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3103	NC_002678	CGC	2	6	1256317	1256322	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3104	NC_002678	CG	3	6	1256349	1256354	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3105	NC_002678	CGC	2	6	1256361	1256366	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3106	NC_002678	ATC	2	6	1257916	1257921	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3107	NC_002678	TCC	2	6	1257928	1257933	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3108	NC_002678	TCCC	2	8	1260350	1260357	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
3109	NC_002678	CGGA	2	8	1260421	1260428	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3110	NC_002678	GAT	2	6	1260437	1260442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3111	NC_002678	TTC	2	6	1260446	1260451	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3112	NC_002678	CGC	2	6	1260457	1260462	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3113	NC_002678	T	6	6	1260466	1260471	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3114	NC_002678	GCGG	2	8	1260491	1260498	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3115	NC_002678	CAT	2	6	1260521	1260526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3116	NC_002678	G	6	6	1260549	1260554	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3117	NC_002678	GC	3	6	1260557	1260562	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3118	NC_002678	CAT	2	6	1260565	1260570	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3119	NC_002678	GGCG	2	8	1262124	1262131	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3120	NC_002678	C	7	7	1262958	1262964	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3121	NC_002678	TCAA	2	8	1266910	1266917	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3122	NC_002678	GCA	2	6	1266935	1266940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3123	NC_002678	CTG	2	6	1266956	1266961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3124	NC_002678	CTG	2	6	1266976	1266981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3125	NC_002678	CGC	2	6	1268373	1268378	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3126	NC_002678	AAC	2	6	1268387	1268392	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3127	NC_002678	CAA	2	6	1268419	1268424	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3128	NC_002678	AGC	2	6	1268462	1268467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3129	NC_002678	AC	3	6	1268473	1268478	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3130	NC_002678	TAG	2	6	1268497	1268502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3131	NC_002678	CCG	2	6	1268561	1268566	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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3254	NC_002678	GCGTC	2	10	1325056	1325065	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
3255	NC_002678	GC	3	6	1327227	1327232	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3256	NC_002678	CG	3	6	1327303	1327308	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3257	NC_002678	TCCCG	2	10	1328648	1328657	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
3258	NC_002678	GGA	2	6	1328710	1328715	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3259	NC_002678	TGA	2	6	1328767	1328772	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3260	NC_002678	CCCG	2	8	1328778	1328785	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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3262	NC_002678	CGC	2	6	1330748	1330753	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3263	NC_002678	GCG	2	6	1330761	1330766	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3264	NC_002678	CGTAA	2	10	1332099	1332108	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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3375	NC_002678	CGCCC	2	10	1402260	1402269	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
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3393	NC_002678	CGA	2	6	1409449	1409454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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